A secção de Rugby do Belenenses surgiu no final do ano de 1928, nove anos após a fundação do Clube, e quando o Belenenses começava a crescer no número de atletas, modalidades e adeptos. A primeira equipa de Rugby disputou a partida inaugural da modalidade no clube contra o Benfica, a 30 de Dezembro desse mesmo ano, jogo que venceu por 10-0. Desde então, várias gerações de jogadores de Rugby fizeram desta modalidade aquela que maior palmarés apresenta no Belenenses, de entre todas as modalidades colectivas, com 7 títulos nacionais seniores, 3 Taças de Portugal e 3 Supertaças.

Actualmente o Belenenses compete em todos os escalões oficiais reconhecidos pela FPR (Sub-8, Sub-10, Sub-12, Sub-14, Sub-16, Sub-18, Sub-20, Seniores e Veteranos), contando com um número superior a 350 atletas. É actual campeão nacional nas categorias de Seniores (XV e Sevens), Sub-20 e Sub-16, tendo igualmente vencido o Torneio Nacional de Sub-14.

O presidente da secção é Manuel Fonseca e Costa, tendo como vice-presidentes António Henrique Tavares (Seniores) e Rui Muralha (Sub-20 e Sub-18). O Director das Escolas de Rugby (escalões inferiores a Sub-16) é Miguel Freudenthal.